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Stages
Stage – Analyste de données – Données probantes quantitatives sur l’impact du changement climatique sur la santé animale à partir de WAHIS et des données historiques de santé animale de l’OMSA, DIAD – Siège de l’OMSA
| Contexte |
| L’Organisation mondiale de la santé animale (OMSA – fondée sous le nom d’OIE) est une organisation intergouvernementale de premier plan qui regroupe 183 membres dans le monde entier. Par ses activités, l’OMSA contribue de manière décisive à l’amélioration de la santé animale, à la protection du bien-être des animaux et au renforcement des services vétérinaires. L’Organisation fournit des informations transparentes sur la situation de la santé animale dans le monde et promeut des normes internationales, notamment en ce qui concerne la sécurité du commerce des animaux vivants et des produits d’origine animale. De plus amples informations sont disponibles sur le site web de l’OMSA. Rejoindre l’OMSA, c’est participer au développement de l’une des principales organisations internationales, reconnue et associée aux autres institutions multilatérales en matière de santé dans le monde. C’est contribuer à l’édification d’une approche globale de la santé au niveau mondial, réunissant santé animale et santé humaine dans le concept d’ « Une seule santé ». C’est rejoindre des équipes motivées par l’impact de leur action, le sens de leur engagement collectif et un professionnalisme reconnu dans leurs domaines de compétences respectifs. Le siège de l’OMSA est à Paris. L’Organisation est présente sur tous les continents par l’intermédiaire de 13 Représentations régionales et sous régionales. L’OMSA emploie 250 agents, dont deux tiers basés au siège. |
| Description du poste |
| Positionnement et rattachement Sous l’autorité du Chef du Département Intégration et Analyse des Données, Gilles Guillot ([email protected]), et sous la supervision de Paolo Tizzani ([email protected]), Épidémiologiste vétérinaire principal. |
| Objectifs du poste Contexte L’Organisation mondiale de la santé animale (OMSA), dont la dénomination statutaire est « Office International des Épizooties », a été créée le 25 janvier 1924. L’OMSA est une organisation intergouvernementale régie par le droit international public et chargée d’améliorer la santé animale dans le monde. Les normes qu’elle élabore concernant les échanges d’animaux vivants et de produits d’origine animale sont reconnues par l’Organisation mondiale du commerce comme références internationales en matière sanitaire. Depuis sa création, l’OMSA collecte des informations sur les maladies animales. Consciente du rôle essentiel des connaissances relatives aux agents pathogènes et aux maladies pour la santé animale et humaine, l’OMSA demande à ses Membres de notifier de manière exhaustive et en temps opportun l’apparition des maladies et agents pathogènes figurant sur sa liste officielle. Ces informations sont collectées et diffusées via le Système mondial d’information zoosanitaire (WAHIS). Celui-ci rassemble les données officielles de 183 Membres de l’OMSA ainsi que d’environ 20 non-Membres et fournit une photographie mondiale de la situation sanitaire animale, avec une série continue d’événements sanitaires disponible depuis 2005. Avant WAHIS, les informations officielles étaient recueillies via le système HandiStatus II, couvrant la période 1996-2004. Pour les décennies antérieures, les informations transmises par les Membres étaient compilées et publiées par l’OMSA dans des publications annuelles et périodiques (telles que les Annuaires de la santé animale mondiale), principalement disponibles aujourd’hui sous format PDF et non encore structurées dans une base de données. Ensemble, ces sources constituent l’un des ensembles de données officielles les plus longs et les plus complets géographiquement sur l’occurrence des maladies animales à l’échelle mondiale, couvrant potentiellement plus de quarante années. Le changement climatique est de plus en plus reconnu comme un facteur majeur influençant la dynamique des maladies infectieuses. Les modifications des températures, des régimes de précipitations et de la fréquence des événements météorologiques extrêmes (vagues de chaleur, sécheresses, inondations) peuvent modifier la transmission des maladies en agissant sur les agents pathogènes, les vecteurs et les hôtes, en modifiant la répartition géographique des vecteurs et des réservoirs sauvages, ainsi qu’en interagissant avec l’utilisation des sols, les systèmes d’élevage, les mouvements d’animaux et les échanges commerciaux. Toutefois, son impact sur la santé animale demeure moins étudié que son impact sur la santé humaine. Une revue systématique récemment co-signée par l’OMSA (Lavarello-Schettini A. et al., Climate change and animal infectious diseases: a systematic review of emerging evidence, Lancet Planetary Health, 2026) n’a identifié que 33 études publiées entre 1970 et 2024 établissant un lien empirique entre des facteurs climatiques et des résultats observés en matière de maladies animales. Si 73 % d’entre elles mettaient en évidence une association positive entre variables climatiques et augmentation du risque de maladie, de l’aire géographique ou de la prévalence, les données disponibles demeurent déséquilibrées sur le plan géographique et taxonomique. Plus de 6 000 études ont été exclues car elles reposaient uniquement sur des indices de convenance environnementale, des abondances vectorielles modélisées ou des résultats synthétiques. La revue appelle les institutions détenant des données longitudinales à les rendre accessibles à la recherche et à intégrer une dimension climatique dans la surveillance sanitaire animale. Grâce à ses archives officielles couvrant plusieurs décennies, l’OMSA est idéalement placée pour contribuer à combler cette lacune. Objectif L’OMSA souhaite produire des données probantes quantitatives robustes sur l’impact du changement climatique et de la variabilité climatique sur la santé animale aux niveaux mondial, régional et national. Pour ce faire, les données historiques officielles sur les maladies animales seront croisées avec des données climatiques, environnementales et d’autres facteurs influençant l’émergence et la propagation des maladies. Ces travaux soutiendront les activités de l’OMSA en matière de changement climatique et d’approche « Une seule santé » et contribueront à des publications institutionnelles et scientifiques. La mission générale du ou de la stagiaire consistera à : Mettre à jour et élargir la revue des connaissances sur le changement climatique et la santé animale. Construire une base de données intégrée à long terme liant les données maladies animales de l’OMSA à des données climatiques, environnementales et autres covariables. Appliquer des méthodes statistiques et spatio-temporelles robustes afin de quantifier les associations entre facteurs climatiques et évolution de l’occurrence, de la saisonnalité et de la distribution géographique des maladies répertoriées par l’OMSA. Objectifs du projet Réaliser une revue systématique ou exploratoire sur l’impact du changement climatique et de la variabilité climatique sur la santé animale. Constituer un jeu de données harmonisé et prêt pour l’analyse des données WAHIS pour la période 2005-2026. Étendre, sous réserve de la qualité des données, cet ensemble à la période 1996-2004 via HandiStatus II et jusqu’à 1980 par extraction des données historiques issues de publications PDF de l’OMSA. Identifier, collecter et harmoniser les variables climatiques, environnementales et autres facteurs influençant l’émergence et la propagation des maladies. Quantifier les associations entre variables climatiques et résultats sanitaires animaux à l’aide de modèles statistiques et spatio-temporels adaptés. Identifier les maladies, espèces hôtes et régions les plus sensibles au climat et documenter l’ensemble des travaux dans une chaîne analytique reproductible ainsi que dans des productions scientifiques. Liste indicative des covariables à considérer Climat Température (moyenne, minimum, maximum et anomalies) Précipitations Humidité Indices de sécheresse (ex. SPEI) Événements météorologiques extrêmes (vagues de chaleur, inondations, sécheresses) Oscillations climatiques à grande échelle (ENSO, dipôle de l’océan Indien, NAO) Environnement et écologie Occupation et changement d’usage des sols Déforestation Indices de végétation (NDVI) Eaux de surface et zones humides Altitude Répartition des vecteurs ou adéquation des habitats Routes migratoires des oiseaux sauvages Populations animales et production Densités de bétail et de volailles Systèmes de production Répartition de la faune sauvage Facteurs humains et socio-économiques Densité de population humaine Commerce des animaux vivants et produits animaux Indicateurs économiques Conflits armés Déplacements de populations Facteurs liés à la surveillance et à la notification Capacités des Services vétérinaires (ex. indicateurs du Processus PVS) Complétude et conformité des notifications Évolutions des systèmes de notification et de classification des maladies afin de tenir compte des biais de déclaration |
| Missions et activités Phase de lancement : matériel et méthodes Document méthodologique décrivant l’approche retenue. Liste des données, accès et infrastructures nécessaires. Plan de travail avec calendrier des livrables. Revue systématique ou exploratoire Élaboration d’un protocole suivant les standards reconnus (PRISMA 2020, PRISMA-ScR, Joanna Briggs Institute). Constitution d’une base documentaire des études examinées. Rapport de synthèse et cartographie des lacunes de connaissances. Construction du jeu de données historique Caractérisation des données WAHIS (2005-2026). Intégration éventuelle des données HandiStatus II. Évaluation de faisabilité et développement d’une chaîne reproductible d’extraction des données historiques depuis les PDF. Constitution d’un fichier maître documenté avec métadonnées et dictionnaire de données. Variables climatiques, environnementales et autres covariables Inventaire des variables retenues et justification. Extraction et agrégation des données. Construction d’un ensemble intégré liant données sanitaires animales et covariables. Analyse quantitative Analyse descriptive des tendances à long terme. Modélisation statistique et spatio-temporelle. Identification et classement des maladies, catégories d’hôtes et régions les plus sensibles au climat. Mise à disposition d’un dépôt versionné contenant l’ensemble des scripts d’extraction, de gestion et d’analyse des données. Rapport final Rapport final présentant les résultats, limites et recommandations. Un ou plusieurs projets d’articles scientifiques. Contributions aux publications et produits de communication de l’OMSA. Présentation des résultats au personnel de l’OMSA. |
| Profil requis |
| Qualifications et expérience Qualifications requises Étudiant·e actuellement inscrit·e ou récemment diplômé·e d’un master (ou équivalent) en épidémiologie, santé publique vétérinaire, biostatistique, statistiques, science des données, sciences de l’environnement ou du climat, géographie/SIG, ou titulaire d’un diplôme en médecine vétérinaire ou sciences du vivant comportant une forte composante quantitative. Aucune expérience professionnelle préalable n’est requise. Toutefois, une expérience pertinente acquise dans le cadre d’enseignements, de projets académiques ou d’un stage est souhaitée dans les domaines suivants : – Analyse statistique de données épidémiologiques, écologiques ou environnementales. – Analyse de séries temporelles. – Manipulation de données spatiales et SIG. – Réalisation ou contribution à une revue systématique ou exploratoire. – Développement de code analytique reproductible. – Rédaction scientifique et documentation méthodologique. Seront considérés comme des atouts : – Modélisation spatio-temporelle ou bayésienne. – Extraction de données à partir de PDF ou documents numérisés. – Connaissances en changement climatique et santé, approche Une seule santé, épidémiologie ou surveillance sanitaire. – Connaissances en surveillance de la santé animale ainsi que des maladies animales transfrontalières et vectorielles. Compétences requises Compétences techniques – Programmation en R et/ou Python – Analyse de données spatiales – Interrogation de bases de données relationnelles (SQL) – Gestion de versions (Git) – Production de rapports reproductibles (Quarto ou R Markdown) – Utilisation d’outils de gestion bibliographique et de sélection d’articles (Zotero, Rayyan, Covidence) – Outils d’extraction de données à partir de PDF – Bonnes pratiques de gestion des données – Documentation structurée du code Compétences supplémentaires – Bonnes capacités informatiques, organisationnelles et relationnelles – Excellentes compétences de communication en anglais – Flexibilité et capacité à respecter des délais rapprochés – La connaissance pratique du français et/ou de l’espagnol constitue un atout, certaines publications historiques de l’OMSA étant disponibles dans ces langues. Le ou la stagiaire veillera à traiter toutes les informations auxquelles il ou elle aura accès avec le plus haut niveau de confidentialité. Toutes les informations ainsi que l’ensemble des codes produits pendant le stage demeurent la propriété de l’OMSA. |
| Informations complémentaires |
| Conditions de travail Poste à temps plein basé au siège de l’OMSA à Paris. – Rémunération : Le salaire mensuel est de 715 EUR. – Durée : 6 mois – Lieu : Siège de l’OMSA, 12 rue de Prony, 75017 Paris, France. Éligibilité et date de début Ce stage nécessite une convention de stage avec l’établissement académique de l’étudiant·e. La sélection du ou de la candidat·e et la date de début du stage dépendront de l’adéquation du profil au poste ainsi que des contraintes opérationnelles et budgétaires. La personne sélectionnée devra pouvoir débuter le stage en présentiel à Paris au plus tard le 14 décembre 2026. |
| Informations générales L’OMSA accorde une grande importance à un environnement de travail multiculturel et positif. L’OMSA est un employeur qui prône l’égalité des chances et accueille les candidatures de tous les candidats qualifiés, indépendamment de leur origine, de leur genre, de leurs opinions ou de leurs croyances. Si cette opportunité vous intéresse, veuillez compléter votre candidature en ligne au plus tard le 15 novembre 2026. Toutes les candidatures seront examinées à l’issue de la date de fin de publication. POSTULER ICI |